国家保密教育培训基地南京分基地（以下简称“教育培训分基地”）是经过国家保密局批准，由国家保密教育培训基地授权于2009年成立的具备从事保密教育培训能力和资格的机构，依托南京大学国家保密学院和信息管理学院，接受国家保密教育培训基地业务领导和江苏省国家保密局指导。教育培训分基地主要承担并完成国家保密教育培训基地下达的培训任务及其他相关工作，也接受全国各地保密系统、政府机关和企事业单位委托的培训任务。分基地的师资主要来自南京大学国家保密学院、南京大学信息管理学院和江苏省国家保密局。分基地办公室设在南大仙林校区信息管理学院楼A101-2室。

培训分基地建立以来，每年都为全国各省、市、自治区保密系统和机关公务员开展相关专业培训。分基地也采取走出去的方式参与军工、军事院校和有关单位内训，十余年来学院共承接了各地企事业单位保密干部培训四百余期，受训人数达数万人，覆盖全国各地区。